Я пользовался программой The Panorama Factory. Если разшение исходников снизить до 2000 dpi (по 20 Mb каждый файл) то она считает все примерно за 10 минут. На больших размерах падает (наверно оперативки надо добавить). После нее практически ничего не правил - только кадрирование.