В фоторедакторе имеются различные графические инструменты для редактирования изображения. Они изображены на панели инструментов, которая расположена слева и может перемещаться мышью по рабочей области редактора.
Для каждого инструмента можно установить дополнительные параметры (панель Параметры инструментов, расположенная в верхней части рабочей области). Панель автоматически меняется в зависимости от выбранного инструмента. На рисунке ниже приведен пример панели настроек инструмента "Губка".
В фоторедакторе Pixlr имеются следующие инструменты:
Инструмент перемещения перемещение выделенных областей изображения, текста и отдельных слоев друг относительно друга.
Обрезка - позволяет кадрировать исходное изображение по заданным размерам.
Лассо - выделение области произвольной формы. Многоугольное лассо, выделяет объект прямыми линиями, проходящими через указанныеточки.
Инструмент выделения - выделение на изображении области в форме прямоугольника или эллипса.
Волшебная палочка - выделяет область, в которой точки имеют сходные цветовые значения (параметр Толерантность).
Карандаш - инструмент для рисования четких линий на изображении.
Кисть - инструмент для рисования сглаженных линий.
Ластик - позволяет стирать области изображения.
Заливка - заполняет выбранным цветом определённые области изображения.
Градиент - создаёт плавный переход от одного цвета к другому.
Клонирующий штамп -позволяет клонировать (делать копию) частей изображения.
Замена цвета – \ для изменения цвета отдельных фрагментов изображения.
Рисование - инструмент для рисования различных геометрических фигур (прямоугольников, кругов и линий).
Размытие - выбранные участки изображения можно сделать размытыми.
Резкость - выбранные участки изображения можно сделать более резкими.
Губка (Насыщенность) - позволяет уменьшать или увеличивать насыщенность цвета выбранной области изображения.
Палец (Смазывание) - выравнивает границу слоев посредством размазывания.
Осветление -для осветления участков изображения.
Затемнение - затемняет области изображения.
Удаление эффекта "красных глаз" - позволяет убрать на фотографии эффект "красных глаз", возникающий от фотовспышки.
Точечная коррекция - предназначена для устранения отдельных деталей на изображении.
Раздувание (Растяжение) - позволяет раздуть определённый участок изображения. Изображение растягивается от центра к краям окружности.
Дисторсия (Сжатие) - сжимает область изображения.
Пипетка - инструмент, позволяющий определить цветовые характеристики отдельных точек изображения.
Текст - инструмент для добавления и редактирования текста.
Рука - позволяет перемещать изображение.
Лупа (Масштаб) -увеличивает или уменьшает масштаб изображения.
Инструмент перемещения перемещение выделенных областей изображения, текста и отдельных слоев друг относительно друга.
Обрезка - позволяет кадрировать исходное изображение по заданным размерам.
Лассо - выделение области произвольной формы. Многоугольное лассо, выделяет объект прямыми линиями, проходящими через указанныеточки.
Инструмент выделения - выделение на изображении области в форме прямоугольника или эллипса.
Волшебная палочка - выделяет область, в которой точки имеют сходные цветовые значения (параметр Толерантность).
Карандаш - инструмент для рисования четких линий на изображении.
Кисть - инструмент для рисования сглаженных линий.
Ластик - позволяет стирать области изображения.
Заливка - заполняет выбранным цветом определённые области изображения.
Градиент - создаёт плавный переход от одного цвета к другому. 
Клонирующий штамп -позволяет клонировать (делать копию) частей изображения.
Замена цвета – \ для изменения цвета отдельных фрагментов изображения.
Рисование - инструмент для рисования различных геометрических фигур (прямоугольников, кругов и линий).
Размытие - выбранные участки изображения можно сделать размытыми.
Резкость - выбранные участки изображения можно сделать более резкими.
Губка (Насыщенность) - позволяет уменьшать или увеличивать насыщенность цвета выбранной области изображения.
Палец (Смазывание) - выравнивает границу слоев посредством размазывания.
Осветление -для осветления участков изображения.
Затемнение - затемняет области изображения.
Удаление эффекта "красных глаз" - позволяет убрать на фотографии эффект "красных глаз", возникающий от фотовспышки.
Точечная коррекция - предназначена для устранения отдельных деталей на изображении.
Раздувание (Растяжение) - позволяет раздуть определённый участок изображения. Изображение растягивается от центра к краям окружности.
Дисторсия (Сжатие) - сжимает область изображения.
Пипетка - инструмент, позволяющий определить цветовые характеристики отдельных точек изображения.
Текст - инструмент для добавления и редактирования текста.
Рука - позволяет перемещать изображение.
Лупа (Масштаб) -увеличивает или уменьшает масштаб изображения. 